Site fouillé entre 1960 et 1972, l’île conserve des monuments mégalithiques de la plus haute importance. 4 cairns regroupant une douzaine de tombes y furent édifiés. Le plus ancien date de 4600 ans avant Jésus-Christ. Les habitants firent construire une série de dolmens au sommet d’une colline constituant ainsi la maison des morts située entre la mer à l’ouest et une forêt profonde à l’est.
Des amphores helléniques ont été retrouvées sur l’île, témoins possibles du passage des Grecs partant à la recherche de l’étain au large de l’île Vierge. Les gaulois s’installèrent à Guénioc se servant des chambres, des couloirs et des dolmens comme abris puis y bâtirent un habitat sommaire. On a retrouvé également sur l’île des vestiges du moyen-âge.
La conservation des monuments a été favorisée par les difficultés d’accès. Guénioc pourrait venir du breton « gaign », désignation souvent péjorative d’un lieu dangereux pour les marins et voulant dire femme de mauvaise vie par allusion au caractère dangereux du débarquement sur l’île…
